199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1578 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  44.35 
 
 
162 aa  125  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  49.6 
 
 
148 aa  124  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  42.96 
 
 
145 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  45.76 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  43.7 
 
 
148 aa  110  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  42.74 
 
 
139 aa  107  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  44.78 
 
 
156 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  45.77 
 
 
162 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  45.77 
 
 
162 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  40.14 
 
 
163 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  40.48 
 
 
182 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  39.69 
 
 
155 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  41.56 
 
 
164 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  42.25 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  39.16 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  36.84 
 
 
149 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  42.86 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  42 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  41.54 
 
 
159 aa  97.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  35.85 
 
 
184 aa  97.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  37.3 
 
 
147 aa  97.1  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  38.64 
 
 
138 aa  97.1  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  41.04 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  34.75 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  35.61 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  40.37 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  35.83 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  49 
 
 
203 aa  94.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  38.52 
 
 
143 aa  94  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  44.64 
 
 
158 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  35.21 
 
 
160 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  40.15 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  39.23 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  31.97 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  37.7 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  36.92 
 
 
149 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  39.1 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  39.1 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  39.23 
 
 
160 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  39.23 
 
 
160 aa  91.3  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  35 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  43.86 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  34.85 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  41.61 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  33.77 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  39.47 
 
 
320 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  38.33 
 
 
160 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  43.7 
 
 
167 aa  87.8  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  39.47 
 
 
149 aa  87.4  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  35.43 
 
 
157 aa  87  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  36.5 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  33.56 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  44.72 
 
 
227 aa  86.3  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  39.84 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  41.04 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  43.56 
 
 
190 aa  85.5  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  35.4 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  35.86 
 
 
302 aa  85.1  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  39.26 
 
 
324 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  40.57 
 
 
328 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  41.51 
 
 
160 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  29.56 
 
 
158 aa  84  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  37.31 
 
 
185 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  36.54 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  35.78 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  38.84 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  37.82 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  37.78 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  37.12 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  35.77 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  42.45 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  32.92 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  32.65 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  35.25 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  41.53 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  35.2 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  37.6 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  35.86 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  37.96 
 
 
338 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  34.65 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  32.71 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  39.81 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  38.68 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  35.11 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  39.05 
 
 
365 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  40 
 
 
357 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  38.79 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  35.82 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  31.97 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  37.61 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  35.83 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>