189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2055 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  34.33 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  31.4 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  36.09 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  35.16 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  35.77 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  33.74 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  30.89 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  27.04 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  29.85 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  33.88 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  31.39 
 
 		 167 aa  72  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  32.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  32.33 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  32.06 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  29.61 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  37.76 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  32.33 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  32.2 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2057  hypothetical protein  28.78 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.858236  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  32.38 
 
 		 338 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  29.41 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  29.1 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  29.32 
 
 		 318 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  29.41 
 
 		 319 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  27.91 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  27.41 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  31.36 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  33.05 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  29.86 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  31.62 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  30.53 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  30.88 
 
 		 160 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  30.83 
 
 		 155 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  32.14 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  32.82 
 
 		 365 aa  62  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  27.59 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  30.88 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  28.81 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  32.81 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  31.13 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  27.78 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  28.67 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  24.53 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  28.93 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  36.07 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  25.83 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  25.3 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  29.85 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1115  protein of unknown function DUF461  31.3 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  30.51 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  30.15 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  30.08 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  28.36 
 
 		 328 aa  58.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  28.48 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  29.13 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  28.04 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  29.91 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  29.91 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  33.88 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  29.81 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  28.04 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  30.53 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  28.36 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  27.48 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  31.58 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  34.74 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  38.75 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3025  hypothetical protein  31.06 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  32.48 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  33.96 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  27.62 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  28.81 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  26.85 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  29.13 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  29.75 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  29.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  29.13 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  32.94 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  26.75 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  28.42 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  31.11 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  30.61 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  31.11 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>