200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1731 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  100 
 
 		 182 aa  353  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  40.26 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  46.77 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  40.48 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  44.09 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  43.31 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  42.52 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  37.06 
 
 		 157 aa  95.1  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  40.58 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  45.19 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  40.58 
 
 		 162 aa  91.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  34.22 
 
 		 167 aa  91.3  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  41.79 
 
 		 149 aa  91.3  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  35.86 
 
 		 227 aa  91.3  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  39.01 
 
 		 158 aa  90.9  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  34.82 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  43.27 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  30.25 
 
 		 145 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  39.37 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  37.37 
 
 		 143 aa  87.8  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  38.26 
 
 		 142 aa  86.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  37.17 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  40.87 
 
 		 154 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  35.45 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  40.29 
 
 		 365 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  40.48 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  34.13 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  38.39 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  39.05 
 
 		 145 aa  85.5  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  36.15 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.89 
 
 		 338 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  34.69 
 
 		 169 aa  85.1  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  36.29 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  29.01 
 
 		 148 aa  84.7  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  36.07 
 
 		 337 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  41.01 
 
 		 357 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  33.64 
 
 		 139 aa  84.3  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  32.65 
 
 		 150 aa  84.3  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  42.73 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  41.96 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  30.56 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  35.82 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  36.55 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  32.52 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  37.27 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  35.92 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  35.71 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  37 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  39.2 
 
 		 320 aa  81.3  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  35.82 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  42.86 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  40.71 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  37.68 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  31.75 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  44.44 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  40.18 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  37.01 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  37.01 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  33.91 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  37.5 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  39.29 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  37.01 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  32.31 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  40.59 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  34.34 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  32.65 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  36.61 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  35.04 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  33.07 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  42.73 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  36.22 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  37.69 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  39.45 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  35.9 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  39.45 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  39.45 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  35.9 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  29.89 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  37.72 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  36.61 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  37.14 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  35.19 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  40.16 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  34.51 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  32.28 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  29.12 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  38.1 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  30.63 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  39.66 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>