196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3051 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  323  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  59.31 
 
 		 159 aa  180  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  53.8 
 
 		 158 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  55.06 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  54.84 
 
 		 155 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  57.62 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  54.55 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  52.6 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  52.6 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  52.6 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  52.6 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  55.48 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  52.15 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  55.48 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  54.79 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  54.79 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  39.13 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  39.13 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  40.94 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.92 
 
 		 162 aa  94  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  36.88 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  38.52 
 
 		 180 aa  91.3  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  36.92 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  90.9  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  36.5 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  32.72 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  39.62 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.84 
 
 		 191 aa  84.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.09 
 
 		 328 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  34.72 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  37.82 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  37.04 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  30.89 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  36 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  35.56 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  28.48 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  35.07 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  35.34 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  36.73 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  33.57 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  30.53 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.04 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  33.57 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  37.29 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  42.72 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  33.77 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  33.87 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.29 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  34.29 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  35.97 
 
 		 302 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  37.21 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  30.71 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  32.64 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  31.87 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  35.77 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  37.01 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  29.46 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  42.72 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  30.4 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  37.01 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  30.4 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  31.97 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  32.64 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  29.63 
 
 		 320 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  35.25 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  33.1 
 
 		 342 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  32.79 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  32.26 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  34.4 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  31.58 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  36.13 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  31.11 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  33.06 
 
 		 338 aa  70.5  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  31.73 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  29.01 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.27 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  31.16 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  34.62 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  39.29 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  27.15 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  32.56 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  34.62 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  28.33 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  30.58 
 
 		 337 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  35.85 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  35.85 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  35.43 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  38.54 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  30.53 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>