197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1897 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  333  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  59.28 
 
 
159 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  60.87 
 
 
162 aa  188  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  61.01 
 
 
162 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  60.28 
 
 
158 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  65.29 
 
 
155 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  56.52 
 
 
154 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  50.89 
 
 
165 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  46.11 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  54.03 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  50.99 
 
 
156 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  50.3 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  56.25 
 
 
160 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  52.03 
 
 
165 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  54.78 
 
 
170 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  55.47 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  54.62 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  51.91 
 
 
302 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  55.46 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  52.82 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  46.9 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  49.64 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  46.48 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  49.04 
 
 
158 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  51.77 
 
 
162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  46.21 
 
 
158 aa  127  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  49.64 
 
 
171 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  40.56 
 
 
150 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  42.06 
 
 
157 aa  101  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  45.28 
 
 
149 aa  99  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  39.88 
 
 
179 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  38.89 
 
 
320 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  35.85 
 
 
173 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  38.82 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  42.54 
 
 
342 aa  90.9  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  43.27 
 
 
319 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  37.12 
 
 
145 aa  88.2  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  36.42 
 
 
175 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  43.7 
 
 
160 aa  87.8  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  36.69 
 
 
351 aa  87.4  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  37.72 
 
 
176 aa  87  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  36.69 
 
 
334 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  38.89 
 
 
323 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  43.88 
 
 
327 aa  84.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  39.42 
 
 
199 aa  84.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  39.13 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  40.71 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  34.97 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  36.75 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  35.22 
 
 
318 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  35.06 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  40.14 
 
 
357 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  33.89 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  34.3 
 
 
307 aa  80.9  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  38.62 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  38.13 
 
 
328 aa  80.9  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  37.21 
 
 
227 aa  80.5  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  30.54 
 
 
184 aa  80.5  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  41.35 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  34.53 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  40.78 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  34.53 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  35.82 
 
 
148 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  37.5 
 
 
365 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  42.72 
 
 
357 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  36.67 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.43 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  35.2 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40.18 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  35.25 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  36.99 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  42.53 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  36.23 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  32.23 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  37.74 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  36.99 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  35.77 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  41.57 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  38.83 
 
 
338 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  37.98 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  35.2 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  32.59 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  32.76 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  31.97 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  42.31 
 
 
321 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  44.19 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  38.71 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  37.61 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  36.91 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  37.9 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  33.77 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  37.9 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  37.9 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  33.77 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  33.85 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  36.89 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  35.25 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>