200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3343 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  321  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  98.15 
 
 		 162 aa  315  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  64.33 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  60.93 
 
 		 155 aa  190  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  61.01 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  64.66 
 
 		 158 aa  175  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  62.59 
 
 		 154 aa  175  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  54.32 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  53.09 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  63.24 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  56.83 
 
 		 195 aa  160  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  58.9 
 
 		 302 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  58.96 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  58.04 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  55.1 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  56.12 
 
 		 162 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  61.95 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  48.15 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  47.74 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  51.45 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  56.72 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  50.69 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  48.78 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  49.28 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  50.36 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  46.76 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  44.19 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  49.61 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  43.17 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  42.4 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  42.41 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  45.77 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  41.84 
 
 		 328 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  35.42 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  47.01 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  48.41 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  43.93 
 
 		 320 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  41.45 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  44.19 
 
 		 179 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  48.11 
 
 		 319 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  37.8 
 
 		 307 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  42.95 
 
 		 185 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  41.12 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  36.59 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  36.88 
 
 		 176 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  45.76 
 
 		 342 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  42.99 
 
 		 337 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  42.86 
 
 		 334 aa  89  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  44.44 
 
 		 351 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  40.3 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  43.88 
 
 		 327 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  40.8 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  34.68 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  43.81 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  37.31 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  35.83 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40.83 
 
 		 172 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  38.52 
 
 		 199 aa  84.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  44.14 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  40.19 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  37.93 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  39.62 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  42.98 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  42.34 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  41.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  37.04 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  34.35 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  35.82 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  34.57 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  42.86 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  34.38 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  41.9 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  38.26 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  31.67 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  38.68 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  32.81 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  39.85 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  45.45 
 
 		 357 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  33.96 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  35.92 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  39.81 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  34.87 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  39.42 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  39.39 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  35.24 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  43.68 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  37.01 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  35.24 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.76 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  38.17 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  38.17 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  33.33 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  39.67 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  32.62 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>