197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0987 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  276  8e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  98.56 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  96.4 
 
 
139 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  51.8 
 
 
139 aa  135  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  45.32 
 
 
148 aa  118  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  40.94 
 
 
145 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  40.3 
 
 
140 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  38.13 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.61 
 
 
160 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  37.3 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  39.52 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  36.09 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  36.09 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  37.38 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  35.16 
 
 
147 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.62 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  32.5 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.07 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  34.15 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  27.54 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  35.54 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  36.92 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  32.2 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  34.56 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  34.62 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  30.69 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.24 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  31.36 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  31.36 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  32.23 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  32.54 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  34.23 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  34.96 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  27.43 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  26.61 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  31.48 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  25.69 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  29.75 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  29.37 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  31.48 
 
 
321 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  28.35 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  28.21 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  29.2 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  29.06 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  34.74 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  28.68 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  26.56 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  28.68 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  28.68 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  28.68 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  31.9 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  29.52 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  30.43 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  31.15 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  36.89 
 
 
195 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  31.9 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  27.91 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  31.3 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.08 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  29.57 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  24.09 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  30.3 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  38.04 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  27.48 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  30.95 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  30.17 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  29.85 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  28.24 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  31.09 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  35.09 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  30.47 
 
 
213 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  28.21 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  36.46 
 
 
203 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  26.5 
 
 
160 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  26.5 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  25.81 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  26.79 
 
 
302 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  33.01 
 
 
195 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  31.03 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  30.4 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2016  hypothetical protein  27.64 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2165  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  28.7 
 
 
175 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  28.7 
 
 
172 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  30.39 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  32.32 
 
 
167 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  31.53 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  27.2 
 
 
318 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  28.7 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  28.7 
 
 
179 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  27.59 
 
 
307 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>