215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3108 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  75.54 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  62.27 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  59.52 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  59.75 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  58.93 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  60.9 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  46.47 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  42.9 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  42.59 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  44.13 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  42.04 
 
 		 342 aa  235  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  40.49 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  42.3 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  38.63 
 
 		 337 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.25 
 
 		 338 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  51.23 
 
 		 176 aa  156  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  53.42 
 
 		 173 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  50.66 
 
 		 174 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  52.98 
 
 		 175 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  50.99 
 
 		 179 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  54.48 
 
 		 174 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  53.73 
 
 		 174 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  50.99 
 
 		 178 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  56.69 
 
 		 172 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  55.15 
 
 		 181 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  30.7 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  50.32 
 
 		 185 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  41.42 
 
 		 175 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  43.62 
 
 		 178 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  38.24 
 
 		 184 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  48.15 
 
 		 167 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  41.83 
 
 		 176 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  50.71 
 
 		 165 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  43.88 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  45.26 
 
 		 199 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  38.29 
 
 		 180 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  42.04 
 
 		 176 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  39.87 
 
 		 176 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  45.07 
 
 		 160 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  39.74 
 
 		 177 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  35.9 
 
 		 196 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  35.42 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  38.16 
 
 		 176 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  43.44 
 
 		 150 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  44.54 
 
 		 156 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  45.38 
 
 		 160 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  39.72 
 
 		 170 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  41.35 
 
 		 167 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  40.77 
 
 		 171 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  40.16 
 
 		 157 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  37.9 
 
 		 157 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  47.12 
 
 		 203 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  37.1 
 
 		 138 aa  88.6  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  38.89 
 
 		 167 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  36.5 
 
 		 156 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  35.92 
 
 		 158 aa  86.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  42.15 
 
 		 168 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  40.29 
 
 		 156 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  40.57 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  37.89 
 
 		 161 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  40.29 
 
 		 156 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  44.23 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  35.81 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  35.53 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  40.34 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  39.62 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  38.84 
 
 		 149 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  35.81 
 
 		 154 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  36.17 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  33.79 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  35.42 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  34.07 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  40.57 
 
 		 149 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  30.43 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  38.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.37 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  38.6 
 
 		 163 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  35.59 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  36.03 
 
 		 160 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  36.03 
 
 		 160 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  34.29 
 
 		 158 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  37.17 
 
 		 165 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  31.16 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  35.09 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  36.5 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  35.29 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  33.83 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  39.32 
 
 		 169 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  34.31 
 
 		 159 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  35.59 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  33.64 
 
 		 145 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  42.34 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  30.6 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  40.54 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>