196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2881 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  278  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  48.03 
 
 
142 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  45.21 
 
 
154 aa  103  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  41.04 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  40.16 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  44.78 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  38.28 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  43.1 
 
 
155 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  35.37 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  37.16 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  36.05 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  40.32 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  45.67 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  40.68 
 
 
191 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  40.3 
 
 
162 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  42.45 
 
 
190 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  40.14 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  40.3 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  39.31 
 
 
213 aa  87  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  38.26 
 
 
182 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  38.28 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  39.5 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  41.54 
 
 
320 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  38.28 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  38.28 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  38.28 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  38.28 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  38.28 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  37.19 
 
 
209 aa  84.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  36.51 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  40.62 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  40.8 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  40.34 
 
 
342 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  36.51 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  36.51 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  36.51 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  38.28 
 
 
148 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  42.74 
 
 
156 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  38.3 
 
 
155 aa  83.6  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.61 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  38.52 
 
 
179 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  37.5 
 
 
167 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  34.25 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  44.14 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  42.4 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  36.88 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  38.4 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  38.28 
 
 
429 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  36.03 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  36.03 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  36.67 
 
 
202 aa  80.5  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  43.85 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  46.53 
 
 
328 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  41.59 
 
 
168 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  42.24 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  36.22 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  41.53 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  37.4 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  30.4 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  37.7 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  34.23 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  35.17 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.44 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  36.3 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  41.41 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  37.1 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  35.83 
 
 
334 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  35.83 
 
 
351 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  37.07 
 
 
176 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  35.04 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  38.66 
 
 
172 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  40.48 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  35.04 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  31.88 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  41.07 
 
 
302 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  34.71 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  36.89 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  37.1 
 
 
319 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  33.56 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  42.72 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  32.37 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  42.48 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  34.43 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  32.37 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  36.67 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  38.28 
 
 
365 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  38.6 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  40.98 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  34.15 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  32.37 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  40.98 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  40.14 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  39.52 
 
 
357 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  35.9 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  32.37 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>