195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0174 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  77.91 
 
 		 162 aa  243  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  65.07 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  63.23 
 
 		 165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  60.99 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  55.78 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  54.94 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  55.1 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  54.19 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  51.27 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  52.41 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  49.09 
 
 		 195 aa  137  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  53.28 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  57.63 
 
 		 302 aa  133  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  49.04 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  49.67 
 
 		 160 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  49.01 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  51.22 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  46.05 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  62.63 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  49.64 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  46.72 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  48.18 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  47.9 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  45.45 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  50.44 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  45.6 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  43.59 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  44.83 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  40.37 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  40.48 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  39.01 
 
 		 342 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  41.96 
 
 		 191 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  38.69 
 
 		 328 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  35.04 
 
 		 320 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  35.58 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.82 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  37.59 
 
 		 150 aa  84  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  37.98 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  35.71 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  34.97 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  39.09 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  43.85 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  33.04 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  39.09 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  40.16 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  35.71 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.07 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.62 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  35.51 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  37.27 
 
 		 338 aa  77.8  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  41.18 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  36.61 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  36.96 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  33.55 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  44.66 
 
 		 203 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  38.98 
 
 		 351 aa  77  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  38.98 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  36.25 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  32.12 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  45.45 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  32.12 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  40 
 
 		 319 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  33.59 
 
 		 307 aa  75.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  35.11 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  33.6 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  42.73 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  43.69 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.03 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  33.09 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  34.21 
 
 		 365 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  39.56 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  38.98 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  32.84 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.04 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  38.46 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  39.17 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  32.82 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  32.2 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  34.59 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  38.18 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  32.14 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  36.96 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  34.78 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  33.11 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  36.3 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  35.77 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.41 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  36.6 
 
 		 213 aa  67.4  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  31.65 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  33.58 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  33.08 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  33.08 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>