188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0598 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  327  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  71.7 
 
 		 159 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  69.38 
 
 		 161 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  68.75 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  68.75 
 
 		 161 aa  224  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  59.73 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  68.15 
 
 		 153 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  68.91 
 
 		 153 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  42.04 
 
 		 184 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  47.65 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  41.72 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  44.53 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  37.67 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  40.4 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  39.52 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  37.89 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  37.8 
 
 		 185 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  43.07 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  40.27 
 
 		 175 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  35.62 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  41.22 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  42.34 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  38.57 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  37.01 
 
 		 173 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  38.96 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40.16 
 
 		 172 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  38.19 
 
 		 181 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  33.55 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  37.14 
 
 		 307 aa  90.5  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  35.07 
 
 		 328 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  39.34 
 
 		 342 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  36.36 
 
 		 320 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  30.99 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  34.04 
 
 		 178 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.07 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  35.46 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  35.25 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.78 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  34.78 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  36.97 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  31.65 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  33.81 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  31.34 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.01 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  42 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  32.77 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  34.17 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.62 
 
 		 351 aa  77.8  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.62 
 
 		 334 aa  77.4  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  35.04 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  34.43 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  37.1 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  34.11 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  33.56 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  34.85 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  33.56 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  38.24 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0618  hypothetical protein  35.37 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  32.59 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  31.29 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  32.89 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  32.58 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  29.93 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  29.33 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  34.07 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  34.38 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  33.05 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  31.54 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  28.66 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  29.22 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  35.43 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  36.75 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  34.29 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  32.82 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  30.95 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  39.08 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  35 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  29.73 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  34.51 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  28.89 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  36.04 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  38.24 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  29.13 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2016  hypothetical protein  34.4 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  31.9 
 
 		 321 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  33.61 
 
 		 365 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  33.61 
 
 		 319 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  26.67 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  33.03 
 
 		 302 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  33.12 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  32.14 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  29.33 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  33.61 
 
 		 357 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  35.63 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  33.66 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>