200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1952 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  333  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  40.85 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  49.19 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  39.73 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  42.96 
 
 		 182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  42.14 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  37.65 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  39.46 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  42.34 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  36.17 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  38.89 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  45.24 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  40.48 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  41.91 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  45.04 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  39.88 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  37.36 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  43.85 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  41.22 
 
 		 191 aa  95.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  36.3 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  36.29 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  34.06 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  36.23 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  44.88 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  44.88 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  44.88 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  39.42 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  91.3  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  35.43 
 
 		 320 aa  90.9  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  37.72 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  35.46 
 
 		 143 aa  90.5  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  39.22 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  39.22 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  33.78 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  36.22 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  36.53 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  42.72 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  38.76 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  36.99 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  32.52 
 
 		 307 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  32.64 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  30.41 
 
 		 178 aa  87.4  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  37.96 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  30.99 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  44.55 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  36.05 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  32.31 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  35.07 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  37.88 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  36.05 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  36.05 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  33.58 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  39.55 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  30.77 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.3 
 
 		 185 aa  84.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  35.88 
 
 		 180 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  36.77 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  35.37 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  34.19 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  32.95 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  33.78 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  42.72 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  35.77 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  39.06 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  35.04 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  40 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  38.36 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  35.46 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  35.76 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  41.75 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  35.85 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  35.34 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  39.37 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  41.96 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  33.59 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  35.07 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  39.23 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  36.96 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  33.73 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  36.25 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  38.26 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  40.15 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  36.27 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.4 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  35.62 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  32.65 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  33.59 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  36.75 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  34.48 
 
 		 338 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  34.69 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  36.76 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  40.52 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  31.61 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  34.85 
 
 		 328 aa  78.2  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  36.44 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>