196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1067 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  421  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  40 
 
 
147 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  42.55 
 
 
149 aa  97.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  36.17 
 
 
145 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  37.75 
 
 
191 aa  89  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  39.31 
 
 
142 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  33.01 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1115  protein of unknown function DUF461  37.41 
 
 
148 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175987  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.72 
 
 
162 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  38.71 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  46.6 
 
 
187 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  30.43 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  34.17 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  35.59 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.81 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  43.44 
 
 
174 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  35.71 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  40.8 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  40.59 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  36.64 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  37.17 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  33.06 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  32.64 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  33.06 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  35.04 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  32.64 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  32.64 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  39.6 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  31.91 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  37.29 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  31.45 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  28.99 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  38.61 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  34.25 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  34.25 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  31.91 
 
 
146 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  30.65 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.41 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  38.17 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  32.85 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  34.81 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  31.93 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  33.9 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  31.93 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  32.48 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  31.93 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  31.93 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  31.93 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  31.93 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  31.93 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  33.56 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  35 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  32.2 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  36.25 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  35.21 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  36.25 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.56 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  39.04 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  39.55 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  34.55 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  33.91 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  36.6 
 
 
158 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  33.04 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  30.82 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  32.48 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  37.3 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  31.94 
 
 
155 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  29.17 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  32.33 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  37.59 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  36.72 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  32.59 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  37.86 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  34.07 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  27.15 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  35.46 
 
 
328 aa  65.5  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  29.93 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  34.59 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  35.45 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1778  protein of unknown function DUF461  32.28 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  30.47 
 
 
139 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  39.05 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  30.95 
 
 
148 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  30.23 
 
 
365 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  29.93 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  28.79 
 
 
148 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  37.59 
 
 
155 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  32.8 
 
 
142 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  30.36 
 
 
148 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>