194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2003 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  47.56 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  51.61 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  44.71 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  45.8 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  40.24 
 
 		 206 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  42.2 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  40.74 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  40.74 
 
 		 160 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  40.74 
 
 		 160 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  45.16 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  38.24 
 
 		 168 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  44.08 
 
 		 232 aa  95.5  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  39.71 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  37.43 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  42.98 
 
 		 193 aa  91.3  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  37.4 
 
 		 145 aa  88.6  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  37.09 
 
 		 213 aa  87.8  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  41.04 
 
 		 168 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  37.86 
 
 		 365 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.45 
 
 		 147 aa  84.3  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  42.18 
 
 		 320 aa  84.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  36.43 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  34.13 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  37.58 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  38.71 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  38.3 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  40.68 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  39.34 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  39.29 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  39.85 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  32.34 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  37.82 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  38.89 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  38.1 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  37.01 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.39 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  37.21 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  29.89 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  39.19 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  37.32 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  34.68 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  39.1 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.57 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  39.69 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  37.88 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  39.84 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  32.48 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  36.07 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  34.3 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  36.76 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  37.59 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  35.94 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  36.15 
 
 		 160 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  37.5 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  31.79 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  37.93 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  34.03 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  38.64 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  36.13 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  38.02 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  36.84 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  40.34 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  40.34 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  36.43 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  30.5 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  32.24 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  36.43 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  36.43 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  32.76 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  31.93 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  36 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  34.62 
 
 		 307 aa  68.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  29.41 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  34.29 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  32.61 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  37.31 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  35.9 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  33.01 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  34.65 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  36.67 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  34.43 
 
 		 351 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  34.43 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  33.01 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.73 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  35.38 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  31.37 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  37.41 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  32.65 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  32.04 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  34.71 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>