140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04130 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  46.27 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  45.77 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  45.93 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  45.93 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  44.27 
 
 		 168 aa  104  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  42.67 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  45.19 
 
 		 160 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  39.23 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  43.85 
 
 		 232 aa  101  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  43.51 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  42.64 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  41.98 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  44.03 
 
 		 168 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  43.2 
 
 		 195 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  33.56 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  34.66 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  38.1 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  36.3 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  33.61 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  41.67 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  32.59 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  31.11 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  37.6 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  34.78 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  45.88 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  33.61 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  38.14 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  33.81 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  31.48 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.28 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  35.37 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35.59 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  31.88 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  33.62 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  31.16 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  29.85 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  31.85 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  32.84 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  36.9 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  36.84 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  34.33 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  31.82 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  42.27 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  42.27 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  33.58 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  39.29 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  46.97 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  33.96 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  32.32 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  35.11 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  35.64 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  40 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  34.07 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  35.51 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  38.46 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  29.23 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  32.69 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  35.51 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  31.82 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  35.24 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  35.92 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  30.15 
 
 		 158 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  34.69 
 
 		 265 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  31.33 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  28.71 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  33.61 
 
 		 165 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  32.09 
 
 		 162 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  28.34 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  41.67 
 
 		 156 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  37.14 
 
 		 173 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  33.94 
 
 		 323 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  36.46 
 
 		 342 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  32.17 
 
 		 161 aa  51.2  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  24.79 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  33.02 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  36.23 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  31.37 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  28.83 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  32.23 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  29.03 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  33.04 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  32.54 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  28.32 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  34.15 
 
 		 338 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  25.66 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  27.78 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  30.89 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  35.34 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  35.19 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  26.61 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>