184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2589 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  82.56 
 
 		 195 aa  329  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  53.08 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  48.44 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  44.63 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  45.22 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  48.91 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  42.2 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  45.16 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  37.85 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  42.67 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  37.06 
 
 		 206 aa  104  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  45.08 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  37.91 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  41.51 
 
 		 147 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  39.29 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  32.02 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  35.9 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.15 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  30.71 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  38.02 
 
 		 139 aa  72  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  40.19 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.88 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  35.16 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  34.45 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  39.22 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  36.89 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  35.2 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  38.38 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  37.29 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  33.88 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  35.59 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  38.04 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  31.82 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  31.15 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  33.06 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  34.58 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  35.96 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  33.62 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  34.26 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  38.89 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  35.11 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  33.09 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  33.63 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  35.35 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  32.2 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  33.96 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  35.45 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  33.04 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  35.45 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  36.52 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  31.36 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  36.79 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  34.62 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  31.72 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  28.77 
 
 		 145 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  31.85 
 
 		 154 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  33.08 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.64 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  34.17 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  31.82 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 302 aa  61.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  39.56 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.65 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  33.59 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  39.6 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  32.46 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  41.38 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  39.6 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  37.29 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  34.58 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  31.43 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  31.58 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  31.58 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  36.78 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  34 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  34.43 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  32.73 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  32.73 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  37.62 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  32.08 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  31.82 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  34.82 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  36.44 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  29.27 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  38.61 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  33.96 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>