179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3399 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  55.07 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  46.07 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  46.21 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  41.92 
 
 		 227 aa  134  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  47.59 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  42 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  42.61 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  45.38 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  38.74 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  40.88 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  43.8 
 
 		 232 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  37.31 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  42.97 
 
 		 160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  42.97 
 
 		 160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  42.97 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  40.91 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  41.74 
 
 		 170 aa  89  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  35.56 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  35.56 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  35.66 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  32.35 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  39.09 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  35.65 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  33.82 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  35.34 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  34.85 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  31.48 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  34.17 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  37.17 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  32.5 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  34.69 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  29.51 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  37.86 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  32.2 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  32.08 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  33.74 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  32.65 
 
 		 147 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  38.66 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  36.08 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  33.82 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  32.43 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  33.81 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  32.26 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  35.19 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  34.55 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  35.88 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  37.8 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  31.97 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  30.63 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  35.4 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  32.99 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  30.65 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  35.11 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  30.65 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  34.41 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  30.58 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  32.61 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  29.01 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  32.39 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  32.87 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  28.35 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  35.16 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  36.19 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  35.11 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.03 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  35.87 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  37.14 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  28.37 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.36 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  33.93 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  32.29 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  29.75 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  30.71 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  34.78 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  29.75 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  29.75 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  30.7 
 
 		 357 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  31.3 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  32.29 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  31.25 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  30 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  28.1 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  32.29 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  28.75 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  31.16 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.86 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  28.68 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.86 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  31.13 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  30.1 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  31.82 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  35.29 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>