191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2883 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  100 
 
 
153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  93.46 
 
 
153 aa  277  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  69.18 
 
 
159 aa  224  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  69.28 
 
 
146 aa  210  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  68.63 
 
 
146 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  78.51 
 
 
150 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  72.44 
 
 
429 aa  201  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  76.03 
 
 
148 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  76.86 
 
 
148 aa  201  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  76.03 
 
 
148 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  76.03 
 
 
148 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  73.02 
 
 
148 aa  199  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  73.02 
 
 
148 aa  199  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  73.02 
 
 
148 aa  199  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  73.02 
 
 
148 aa  199  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  73.02 
 
 
148 aa  199  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  73.02 
 
 
148 aa  199  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  73.02 
 
 
148 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  45.83 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  45 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  42.66 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  42.98 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  43.33 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  43.33 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  39.04 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  36.84 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  34.19 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  43.59 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  35.71 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  38.26 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  41.03 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  41.44 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.72 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  36.57 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  36.57 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  36.96 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  34.33 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  33.8 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  33.8 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  33.8 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  34.09 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  36.57 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  33.8 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  37.96 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  29.25 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  31.47 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  32.84 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  35.29 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  37.16 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  30.95 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  32.58 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  33.81 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  37.3 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  30.46 
 
 
195 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  31.43 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  35.88 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  31.97 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  34.75 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  30.07 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  34.13 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  31.47 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  35.65 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.08 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  33.6 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.36 
 
 
191 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  34.48 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  36.92 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  30.66 
 
 
173 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  32.5 
 
 
232 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  36.36 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  33.62 
 
 
357 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  34.38 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  31.15 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  37.82 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  35.48 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  31.93 
 
 
202 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  34.82 
 
 
302 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  28.47 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  34.03 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  34.45 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  29.93 
 
 
176 aa  61.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  37.14 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  36.89 
 
 
167 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35 
 
 
162 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  27.33 
 
 
190 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  34.15 
 
 
199 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  30.08 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  34.17 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  33.93 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  33.93 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  32.85 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  32.35 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  31.36 
 
 
328 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  33.93 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  33.93 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  32.5 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  34.55 
 
 
357 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>