195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1239 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  93.46 
 
 		 153 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  67.92 
 
 		 159 aa  222  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  70.59 
 
 		 146 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  69.93 
 
 		 146 aa  216  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  79.34 
 
 		 148 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  79.34 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  79.34 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  74.6 
 
 		 429 aa  204  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  79.34 
 
 		 150 aa  204  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  78.51 
 
 		 148 aa  204  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  74.6 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  74.6 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  74.6 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  74.6 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  74.6 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  74.6 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  74.6 
 
 		 148 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  48.33 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  45 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  44.63 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  41.26 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  43.33 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  43.33 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  38.36 
 
 		 169 aa  98.6  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  40.35 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  35 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  34.51 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  39.13 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  35.07 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.03 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  37.8 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  34.85 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  38.46 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  32.58 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  32.58 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  32.58 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  35.29 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  32.58 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  33.58 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  37.23 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  32.17 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  38.74 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  38.1 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  34.92 
 
 		 365 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.07 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  34.46 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  34.13 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  28.23 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  35.59 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  36.64 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  30.34 
 
 		 184 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  32.12 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  28.86 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  32.37 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  31.65 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  34.48 
 
 		 357 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  32.8 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  34.55 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  34.48 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  35.4 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  34.82 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  31.75 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  30.66 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  33.83 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  31.36 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  33.04 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  31.03 
 
 		 328 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  32.35 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  31.73 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  27.01 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  34.68 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  31.4 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  32.77 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  31.4 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  34.23 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  36.54 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  27.5 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  30.69 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  30.99 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  29.37 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  29.93 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  34.11 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3066  protein of unknown function DUF461  37.7 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000562803  hitchhiker  0.00471695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  30.43 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  36.19 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  34.58 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  33.57 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  31.72 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  34.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  32.81 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>