185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3383 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  97.97 
 
 
148 aa  298  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  85.81 
 
 
148 aa  260  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  84.46 
 
 
148 aa  246  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  81.76 
 
 
148 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  44.14 
 
 
146 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  43.45 
 
 
146 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  43.75 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  43.75 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  43.06 
 
 
148 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  45 
 
 
150 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  43.09 
 
 
148 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  45.83 
 
 
148 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  42.28 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  42.28 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  42.28 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  42.28 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  42.28 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  42.28 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  42.28 
 
 
429 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  43.59 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  42.5 
 
 
159 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  42.86 
 
 
153 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  37.19 
 
 
169 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  35 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  32.24 
 
 
184 aa  84.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  37.84 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  34.75 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  41.03 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  31.85 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  33.56 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  33.86 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  30 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  35.85 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  33.85 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  33.08 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  37.37 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  35.09 
 
 
167 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  39.32 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  33.9 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  38.38 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  35.24 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  35.85 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  35.24 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  39.32 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  35.24 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  31.71 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  36 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  34.91 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  32.76 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  34.46 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  32.5 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  31.08 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  31.62 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  31.94 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  28.99 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  33.78 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  27.82 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  36.79 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  32.48 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.29 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  30.23 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  30.23 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  33.86 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  33.63 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  32.09 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  32.52 
 
 
302 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  32.33 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  29.37 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  34.03 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  29.84 
 
 
320 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  32.82 
 
 
158 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  28.35 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  30.56 
 
 
163 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  32.67 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  34.19 
 
 
206 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  28.03 
 
 
213 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  33.96 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  33.05 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  32.58 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  38.1 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  35.4 
 
 
357 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  33.11 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  30.23 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  30.09 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  31.9 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  31.88 
 
 
162 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  33.63 
 
 
365 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  35.51 
 
 
357 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3534  hypothetical protein  28.33 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.805739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  31.76 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  29.13 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  28.35 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  25.74 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  32.12 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  27.12 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  31.16 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>