94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3534 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3534  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.805739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  29.41 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  28.33 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  28.33 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  29.81 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  29.46 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  27.5 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  28.45 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  26.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  26.89 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  30.77 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  29.66 
 
 		 334 aa  54.3  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  25.86 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  29.91 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  29.66 
 
 		 351 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  27.97 
 
 		 342 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  25.83 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  30.83 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  25.42 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  27.13 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  25.93 
 
 		 338 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  28.93 
 
 		 320 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  27.83 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  28.33 
 
 		 357 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  24.8 
 
 		 145 aa  51.2  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  23.73 
 
 		 173 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  29.75 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  23.68 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  28.93 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  27.5 
 
 		 365 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  28.1 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  26.67 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  26.42 
 
 		 337 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2057  hypothetical protein  29.91 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.858236  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  26.67 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  29.25 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  28.1 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  28.3 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  28.3 
 
 		 327 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  28.21 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  28.21 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  28.21 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  24.67 
 
 		 318 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  29.51 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  26.05 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  24.38 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  29.09 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  28.1 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  27.87 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  28.46 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  27.68 
 
 		 357 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  22.15 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  25 
 
 		 321 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  28.21 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  26.72 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  26.72 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  26.72 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  27.13 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  26.72 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  26.39 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  26.72 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  26.72 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  28.21 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  27.97 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  25.6 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  25.83 
 
 		 324 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  22.69 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  22.88 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  27.34 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  26.61 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  26.72 
 
 		 429 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  27.13 
 
 		 302 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  24.58 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  28.7 
 
 		 158 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  22.43 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  27.34 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  26.23 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  22.95 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  26.09 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  24.58 
 
 		 323 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  22.03 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  22.03 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  26.27 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  28.16 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  23.33 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  23.77 
 
 		 172 aa  42  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  26.92 
 
 		 162 aa  42  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  27.59 
 
 		 227 aa  42  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  24.58 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  28.12 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  26.17 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  24.79 
 
 		 319 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>