186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4714 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  99.38 
 
 		 161 aa  323  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  97.52 
 
 		 161 aa  318  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  88.2 
 
 		 159 aa  289  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  68.75 
 
 		 159 aa  224  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  58 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  63.04 
 
 		 153 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  56.34 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  63.33 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  54.23 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  42.77 
 
 		 184 aa  130  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  40.76 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  42.31 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  36.25 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  41.67 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  39.39 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40.62 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  37.76 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.81 
 
 		 185 aa  94  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  37.41 
 
 		 307 aa  93.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  38.16 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  37.5 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  39.2 
 
 		 191 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  38.52 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  37.24 
 
 		 181 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  34.93 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.97 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  36.97 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  36.84 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  36.84 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.84 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  35.46 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  35.16 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  34.27 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  34.15 
 
 		 320 aa  80.5  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  31.97 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0618  hypothetical protein  39.33 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  36.62 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  78.2  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.08 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  34.71 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  34.78 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  31.75 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  35.51 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2016  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  35.48 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  39.32 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  39.32 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  29.3 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  34.71 
 
 		 327 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  34.71 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  39.32 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  31.82 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  33.04 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  35.09 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  27.66 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  43.43 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  40.38 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  30.66 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  36.51 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  40.17 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  35.1 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  32.72 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  34.17 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  30.66 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  37.01 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  31.06 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  30.89 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  30.83 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  31.85 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  36.79 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  35.19 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  34.68 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  32.59 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  31.15 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  31.93 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  37.86 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  39.24 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  36.44 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  30.63 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  31.11 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  31.65 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  28.29 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  36.44 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  29.61 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1778  protein of unknown function DUF461  30.15 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  30.34 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  34.68 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  28.46 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>