193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1131 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  304  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  304  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  93.1 
 
 
146 aa  286  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  93.79 
 
 
146 aa  285  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  96.97 
 
 
148 aa  248  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  89.66 
 
 
150 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  78.38 
 
 
148 aa  238  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  78.38 
 
 
429 aa  238  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  78.38 
 
 
148 aa  238  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  78.38 
 
 
148 aa  238  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  78.38 
 
 
148 aa  238  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  78.38 
 
 
148 aa  238  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  78.38 
 
 
148 aa  238  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  77.7 
 
 
148 aa  234  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  68.21 
 
 
153 aa  207  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  66.89 
 
 
153 aa  203  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  74.59 
 
 
159 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  48 
 
 
148 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  45.99 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  45.99 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  45.6 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  42.36 
 
 
148 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  45.6 
 
 
148 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  39.47 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  44.12 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  35.37 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  40 
 
 
142 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  32.35 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  36.57 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.93 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  33.8 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  30.99 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  29.37 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  34.87 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  33.08 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  31.34 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  32.26 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  35.9 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  37.1 
 
 
365 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  33.6 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  37.29 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  34.31 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  35 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  29.85 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  31.4 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  29.79 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  35.34 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  36.94 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  31.37 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  35.29 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  30.28 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  32.85 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  34.56 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  34.27 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  37.17 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.72 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  34.38 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.84 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  34.45 
 
 
328 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  30.34 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  30.88 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.71 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  36.13 
 
 
185 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  33.62 
 
 
319 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  30 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  34.38 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  37.25 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  33.86 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  33.59 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  38.3 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  40.22 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  30.14 
 
 
307 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  31.54 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  35.24 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  35.29 
 
 
324 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  29.59 
 
 
190 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  34.19 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  34.13 
 
 
181 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  32.28 
 
 
193 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  28.47 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  28.35 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  30.33 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  29.71 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  31.67 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  31.79 
 
 
176 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  26.56 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  30.43 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  31.03 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  30.37 
 
 
165 aa  60.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  34.96 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  30.23 
 
 
302 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  31.79 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  34.23 
 
 
165 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>