198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3239 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  99.38 
 
 		 160 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  99.38 
 
 		 160 aa  326  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  91.16 
 
 		 160 aa  278  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  83.23 
 
 		 161 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  80 
 
 		 160 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  80 
 
 		 160 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  80 
 
 		 160 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  80 
 
 		 160 aa  266  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  66.22 
 
 		 162 aa  203  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  64.38 
 
 		 158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  61.59 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  60.26 
 
 		 155 aa  183  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  57.32 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  56.25 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  54.84 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.12 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  35.38 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  39.23 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  35.75 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  34.07 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  43.3 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  35.29 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  84.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  36.23 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  33.59 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  34.17 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  42 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  37.3 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  36.67 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  36.51 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  37.01 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  30.32 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  37.74 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  32.47 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  37.74 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  37.5 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  34.68 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  34.43 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  32.77 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  33.61 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  35.04 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  34.01 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  37.39 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  37.39 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  32 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  37.39 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  36.79 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  33.1 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  35 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  36.79 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  35.94 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  32.37 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  36.04 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  31.91 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  31.91 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  35.85 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  35.85 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  31.43 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  35.78 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  35.43 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  33.93 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  34.65 
 
 		 202 aa  70.5  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  30.25 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  34.34 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  26.88 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  31.93 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  32.82 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  36.52 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  34.45 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  31.09 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  29.63 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  30.33 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  29.25 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  32.79 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  35.04 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  26.61 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  33.87 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  26.47 
 
 		 328 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  37.39 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  35.04 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  35.19 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  27.13 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  27.82 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  33.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  33.06 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  35.4 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  29.17 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  26.61 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  33.06 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  31.36 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  36.54 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  33.87 
 
 		 199 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  34.23 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  35.54 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>