198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0541 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  60.13 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  57.52 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  61.27 
 
 		 160 aa  173  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  61.27 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  59.15 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  60.56 
 
 		 160 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  59.44 
 
 		 161 aa  167  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  58.04 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  58.04 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  58.04 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  55.03 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  58.04 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  53.38 
 
 		 159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  57.93 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  49.37 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  39.24 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  39.5 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  38.93 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  39.2 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  41.91 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  33.77 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.33 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  37.6 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  35.92 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.58 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  34.85 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  33.62 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  33.77 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.77 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  35.14 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  38.06 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  36.61 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  37.1 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  28.15 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  29.86 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  32.33 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  36 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  30.69 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  29.77 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  30.69 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  35.14 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  30.63 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  35.48 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  39.81 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  36.94 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  30.58 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  37.72 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  35.48 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  30.71 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  34 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  31.9 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  31.93 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  32.7 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  32.26 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  34.53 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  34.06 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35.71 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  38.05 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  28.19 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  32.2 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  30.72 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  31.93 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  31.61 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  30.67 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  33.82 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  37.86 
 
 		 204 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  34.38 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  31.94 
 
 		 213 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  38 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  38 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  36.73 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  35.78 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  29.32 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  31.76 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  34.81 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  33.33 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  33.98 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  35.88 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  32.48 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  35.82 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  32.48 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1115  protein of unknown function DUF461  36.07 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  33.86 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  32.54 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  32.56 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  31.85 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  32.28 
 
 		 342 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  35.07 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  31.62 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  32.45 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  38.24 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>