178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00576 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  38.66 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  42.28 
 
 
150 aa  91.3  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  41.91 
 
 
155 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  39.26 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  38.76 
 
 
151 aa  87.8  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  36.76 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  34.35 
 
 
327 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  36.13 
 
 
265 aa  85.9  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  37.41 
 
 
163 aa  85.1  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  38.35 
 
 
155 aa  84.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  32.09 
 
 
320 aa  84.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  35.54 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  37.19 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  29.33 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  39.34 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  37.7 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  35.76 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  35.76 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  35.34 
 
 
328 aa  81.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  33.83 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  32.58 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  39.34 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  34.92 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  32.54 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  39.1 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  36.59 
 
 
148 aa  79  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  35.15 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  34.07 
 
 
158 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  36.07 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  31.67 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  36.89 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  32.33 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.54 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  35.46 
 
 
302 aa  77.8  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  36.89 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  36.59 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  38.4 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  36.59 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  36.59 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  36.59 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.43 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  30.05 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  32.41 
 
 
365 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  28.35 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  30.16 
 
 
338 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  33.09 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  32.84 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  35.71 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  34.68 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.14 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  33.06 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  35.66 
 
 
342 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  32.33 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  31.58 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  31.11 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  33.83 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  29.23 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  29.34 
 
 
334 aa  68.6  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  29.34 
 
 
351 aa  68.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  33.03 
 
 
318 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  32.09 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  30.83 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  31.62 
 
 
357 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  32.59 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  30.94 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  29.37 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  30.95 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  32.2 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  31.78 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  35.45 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  29.6 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  31.37 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  30.95 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  31.37 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  36.94 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  27.81 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  30.16 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  29.93 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  32.84 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  32.31 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  30.94 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  28.03 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  25.16 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  31.9 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  36.36 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  33.94 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  29.1 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  33.8 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  28.37 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  29.57 
 
 
319 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  29.53 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  29.79 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>