220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5608 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  100 
 
 		 321 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  48.41 
 
 		 318 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  46.89 
 
 		 323 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  50.36 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  44.48 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  44.59 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  43.31 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  44.22 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  43.45 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  44.06 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  42.63 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  40.73 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  40.43 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  40.43 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  39.94 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  38.99 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  51.28 
 
 		 173 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  52.08 
 
 		 175 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  48.7 
 
 		 176 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  57.26 
 
 		 172 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  50.97 
 
 		 179 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  54.07 
 
 		 185 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  53.33 
 
 		 174 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  51.82 
 
 		 176 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  47.3 
 
 		 176 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  48.03 
 
 		 180 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  45.39 
 
 		 178 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  34.87 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  46.53 
 
 		 178 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  39.74 
 
 		 177 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  37.06 
 
 		 175 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  49.21 
 
 		 174 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  49.21 
 
 		 174 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  45.74 
 
 		 156 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  39.24 
 
 		 176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  37.28 
 
 		 184 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  46.88 
 
 		 181 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  38.41 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  46.77 
 
 		 167 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  41.84 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  43.97 
 
 		 160 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  34.5 
 
 		 196 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  47.5 
 
 		 191 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  45.38 
 
 		 165 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  41.94 
 
 		 199 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  48.36 
 
 		 151 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  45.69 
 
 		 167 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  98.6  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  32.3 
 
 		 264 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  38.84 
 
 		 170 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  38.89 
 
 		 156 aa  92.8  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  38.89 
 
 		 156 aa  92.8  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  32.37 
 
 		 243 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  36.09 
 
 		 158 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  45.63 
 
 		 203 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  40.65 
 
 		 150 aa  89.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  34.97 
 
 		 158 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  32.45 
 
 		 166 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  31.9 
 
 		 245 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  44.9 
 
 		 204 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  38.98 
 
 		 158 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  38.98 
 
 		 184 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  37.6 
 
 		 157 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  39.2 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  36.72 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  40.32 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  44.14 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  41.67 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  42.98 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  44.14 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  32.52 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  38.41 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  40.17 
 
 		 169 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  41.96 
 
 		 149 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  41.38 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  35.59 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  38.98 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  39.47 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.93 
 
 		 162 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  44.86 
 
 		 158 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  38.18 
 
 		 160 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  37.23 
 
 		 162 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  37.61 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  38.3 
 
 		 171 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  38.46 
 
 		 163 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  38.18 
 
 		 160 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  39.34 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  33.8 
 
 		 158 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  37.82 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  43.93 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  35.43 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  33.57 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  35.4 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  29.46 
 
 		 139 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>