204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  95.57 
 
 		 158 aa  292  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  58.7 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  56.86 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  56.86 
 
 		 161 aa  166  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  56.21 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  55.56 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  49.03 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  48.34 
 
 		 184 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  53.28 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  43.79 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  52.54 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  41.67 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  39.87 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  42.04 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  40.65 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  39.26 
 
 		 176 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  43.15 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  40.94 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  41.03 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  37.82 
 
 		 179 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  43.28 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  42.06 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  43.28 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  39.61 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  33.8 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  40.41 
 
 		 181 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  38.04 
 
 		 307 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  40.97 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  38.71 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  39.26 
 
 		 318 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  39.02 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  36.15 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.07 
 
 		 191 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.4 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  38.21 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  40 
 
 		 365 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  38.52 
 
 		 324 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  42.74 
 
 		 319 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  36.92 
 
 		 320 aa  91.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  38.33 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  37.39 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  41.53 
 
 		 357 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  35.71 
 
 		 338 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  38.33 
 
 		 199 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  35.56 
 
 		 321 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  35.54 
 
 		 337 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  39.39 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  37.6 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  32.31 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0618  hypothetical protein  36.99 
 
 		 179 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  36.57 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  43.75 
 
 		 204 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  31.51 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  40.48 
 
 		 357 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  39.53 
 
 		 323 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.77 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  35.56 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  35.81 
 
 		 195 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  30.87 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  29.93 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  33.81 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  39.58 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  29.03 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  35.07 
 
 		 328 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  26.39 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  31.51 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  34.39 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  31.75 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  36.3 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  34.68 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  37.07 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  33.94 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  33.83 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  30.6 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  35.45 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  35.16 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  31.03 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  34.75 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  34 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  36.21 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  36.21 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  36.21 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  36.67 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.06 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.06 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  34.23 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  34.23 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  34.23 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  32.14 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  32.74 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>