195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4881 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  313  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  90.2 
 
 		 153 aa  235  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  67.33 
 
 		 159 aa  209  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  65.36 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  63.4 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  62.75 
 
 		 161 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  62.75 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  63.76 
 
 		 160 aa  193  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  52.99 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  52.24 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  46.21 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  44.22 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  45.52 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  40.82 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  40.85 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  42.07 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  41.98 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  44.09 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  41.73 
 
 		 174 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  37.69 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  43.38 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  39.72 
 
 		 173 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  41.01 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  42 
 
 		 166 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  39.42 
 
 		 176 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  38.85 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  37.42 
 
 		 185 aa  94.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  36.24 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.29 
 
 		 191 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  35.29 
 
 		 307 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  37.34 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  40.5 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  35.17 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  37.59 
 
 		 365 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  40.68 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  39.32 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  30.41 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  37.7 
 
 		 320 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  39.32 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  34.25 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  38.52 
 
 		 357 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.44 
 
 		 338 aa  84  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  39.83 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  39.83 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  39.83 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  35.59 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  38.02 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  36.84 
 
 		 318 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  37.29 
 
 		 319 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  34.81 
 
 		 323 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  37.8 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  32.58 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  37.29 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  37.29 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  32.45 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  31.79 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  31.79 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  32.79 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  35.14 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  34.13 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  29.41 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  28.68 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  38.24 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  36.28 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  36.44 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  32.54 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  32.77 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  32.64 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  39.22 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  26.81 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  39.42 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  35.94 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  34.17 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  34.96 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  29.86 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  30 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  33.58 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  35.94 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  32.45 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  37.84 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  34.45 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  29.08 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  36.7 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  32.71 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  32.03 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  26.43 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  33.03 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  33.9 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  32.54 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.15 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  35.04 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  31.47 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.15 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>