195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4932 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  64.71 
 
 
170 aa  156  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  58.74 
 
 
162 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  56.62 
 
 
195 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  58.04 
 
 
162 aa  153  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  63.48 
 
 
165 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  56.83 
 
 
302 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  45.57 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  52.03 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  44.44 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  46.38 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  48.82 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  46.21 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  44.2 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  44.9 
 
 
154 aa  124  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  56.44 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  46.05 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  46.46 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  45.59 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  40.94 
 
 
160 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  43.05 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  42.03 
 
 
164 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  36.76 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  42.96 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  38.3 
 
 
150 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  39.69 
 
 
162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  40.46 
 
 
160 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  34.81 
 
 
162 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  38.46 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  43.51 
 
 
328 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  43.88 
 
 
173 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  37.67 
 
 
327 aa  94.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  39.42 
 
 
307 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  43.4 
 
 
175 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  38.35 
 
 
320 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  42.75 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  42.19 
 
 
199 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  39.84 
 
 
191 aa  91.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  42.99 
 
 
337 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  40.31 
 
 
174 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  40.71 
 
 
149 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  42.86 
 
 
319 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  39.22 
 
 
365 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  36.57 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  39.71 
 
 
185 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.67 
 
 
163 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  37.7 
 
 
338 aa  87.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  38.64 
 
 
176 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  42.96 
 
 
357 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  42.48 
 
 
334 aa  85.5  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.4 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  36.3 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  42.48 
 
 
351 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  37.74 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  37.5 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  36.62 
 
 
178 aa  84  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  44.14 
 
 
357 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  33.11 
 
 
342 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.48 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  39.64 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  35.21 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  42.57 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  38.97 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  32.84 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  36.3 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  35.09 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  44.86 
 
 
321 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  35.07 
 
 
323 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  32.69 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  35.83 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  41.58 
 
 
318 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  34.07 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  39.45 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  31.91 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  36.57 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  35.66 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  32.68 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  33.1 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  37.84 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  35.71 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  31.69 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  30.37 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  32.64 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.61 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  34.46 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  27.27 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  32.03 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  32.03 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  32.89 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  32.89 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  32.03 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  34.01 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  33.61 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  31.11 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  32.7 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  35.71 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  29.2 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>