195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4042 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  40.62 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  36.67 
 
 		 184 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  37.7 
 
 		 191 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  38.98 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  34.85 
 
 		 160 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  40.19 
 
 		 158 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  39.84 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  36.52 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  38.21 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  39.25 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  32.62 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  36.52 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  33.77 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  36.89 
 
 		 148 aa  84.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  36.89 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  35.2 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  34.53 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35.11 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  36.92 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  37.7 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  34.15 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  34.51 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  32.5 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  34.35 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  32.62 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  33.86 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  36.21 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  31.45 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  37.82 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  33.77 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  39.81 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  37.04 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  38.33 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  30.88 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  34.21 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  38.61 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  38.1 
 
 		 328 aa  77  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  33.58 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  33.88 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  30.58 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  35.71 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  37.04 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  29.66 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  32.73 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  31.01 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  34.33 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  39.42 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  39 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  32.23 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  36.21 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.61 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  32.5 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  32.09 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  31.06 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  33.94 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  32.81 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  34.15 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  34.13 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  30.4 
 
 		 320 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  37.38 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  33.62 
 
 		 167 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  28.91 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  37.86 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  31.2 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  36.04 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  32.71 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  38.53 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  32.69 
 
 		 338 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  33.82 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  38.78 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  31.69 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  41.11 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  29.85 
 
 		 199 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  39.76 
 
 		 178 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  33.61 
 
 		 202 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  34.21 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  39.24 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  32 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  32.65 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  27.83 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>