201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2476 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  47.37 
 
 		 185 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  52.5 
 
 		 357 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  50.77 
 
 		 365 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  52.59 
 
 		 319 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  42.41 
 
 		 176 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  52.59 
 
 		 357 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  46.56 
 
 		 324 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  47.29 
 
 		 321 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  48.06 
 
 		 318 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  46.72 
 
 		 174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  40.91 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  46.72 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  39.07 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  45.24 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  42.96 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  42.03 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  41.8 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  40.46 
 
 		 167 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  38.3 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  44 
 
 		 320 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  39.31 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  46.94 
 
 		 203 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  45.76 
 
 		 328 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  43.9 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  48.98 
 
 		 204 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  39.66 
 
 		 342 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  42.5 
 
 		 181 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  44.54 
 
 		 323 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  41.88 
 
 		 199 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  36.54 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  41.94 
 
 		 191 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  39.66 
 
 		 334 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  39.66 
 
 		 351 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  34.19 
 
 		 172 aa  97.1  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  35.25 
 
 		 307 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  38.58 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  44.72 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  37.12 
 
 		 170 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  35.04 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  39.06 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  39.44 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  39.74 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  39.06 
 
 		 265 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  39.5 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  39.26 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  35 
 
 		 184 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  39.26 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  34.59 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.75 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  36.45 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  41.35 
 
 		 171 aa  84  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  40.65 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  40.65 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  38.58 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  40.62 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  41.51 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  30.56 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  26.98 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  40.19 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  38.76 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  31.93 
 
 		 337 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  32.05 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  37.69 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  34.91 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  34.58 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  31.97 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  38.69 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  38.69 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  39.23 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  38.69 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  38.46 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  36.97 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  35.42 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  33.09 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  39.01 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  39.17 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  32.76 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  39.17 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  45.24 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  32.43 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  32.23 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  36.29 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  29.66 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  28.32 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  31.82 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  42.2 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  27.43 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  37.61 
 
 		 302 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.07 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1778  protein of unknown function DUF461  36.11 
 
 		 187 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  31.45 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  35.53 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  29.81 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  31.88 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>