184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1251 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2057  hypothetical protein  37.61 
 
 		 177 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.858236  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  35.11 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  34.33 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  37.61 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  38.66 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  37.31 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  41.58 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  36.62 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.09 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  36.64 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  35.92 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  34.33 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  37.86 
 
 		 320 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  35.94 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  33.78 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  35.34 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  37.14 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  38.26 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  36.5 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  38.83 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  33.09 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  35.34 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  38.24 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  38.24 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  38.83 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  35.85 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  36.75 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  34.04 
 
 		 338 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  38.46 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  34.92 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.13 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  31.69 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  37.86 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  37.86 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  37.86 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  35.83 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  27.94 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  35.92 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.59 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  39.02 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  32.98 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  34.43 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35.59 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  36.54 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  35.83 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  35.58 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  27.18 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  35.46 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  30.85 
 
 		 180 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  30.83 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  35.46 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  30.83 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  36.56 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  30.63 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  31.82 
 
 		 337 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  29.34 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  35.92 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  36.19 
 
 		 307 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  30.28 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.97 
 
 		 334 aa  60.1  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  30.3 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.97 
 
 		 351 aa  60.1  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  31.34 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  31.25 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  28.57 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  30.28 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  34.75 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  33.1 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  32.61 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  38.18 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  33.64 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  29.32 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  29.79 
 
 		 187 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  32.67 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  39.53 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  27.54 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  30.4 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  31.85 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  32.79 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  31.01 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  26.96 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  31.06 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  32.33 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  33.05 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>