202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3421 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  48.08 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  47.97 
 
 		 173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  48 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  46.98 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  45.03 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  39.74 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  43.75 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  37.89 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  43.61 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  42.28 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  44.88 
 
 		 328 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  40.94 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  44.26 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  46.46 
 
 		 151 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  55.1 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  53.12 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  43.85 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  54.08 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  46.34 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  43.2 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  46.21 
 
 		 321 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  42.14 
 
 		 161 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  48.67 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  41.8 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  35.67 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  43.94 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  45.86 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  38.41 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  38.58 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  39.52 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  40.43 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  41.13 
 
 		 318 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  43.48 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  46.9 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  40.14 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  47.57 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  43.85 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  48.6 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  38.89 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  42.75 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  48.15 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  45.22 
 
 		 156 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  41.96 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  40 
 
 		 320 aa  98.6  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  41.18 
 
 		 167 aa  98.6  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  40.15 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  40.12 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  38.36 
 
 		 342 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  44.83 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  46.88 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  42.65 
 
 		 158 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  43.97 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  41.53 
 
 		 334 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  36.07 
 
 		 158 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  41.53 
 
 		 351 aa  94  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  35.37 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  43.1 
 
 		 319 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  41.88 
 
 		 156 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  38.64 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  39.2 
 
 		 161 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  35.25 
 
 		 158 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  42.5 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  37.7 
 
 		 147 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  92  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  39.2 
 
 		 161 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  36.6 
 
 		 159 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  41.41 
 
 		 365 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  39.84 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  43.7 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  39.83 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  39.84 
 
 		 158 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  43.75 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  39.26 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  41.18 
 
 		 338 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  40.15 
 
 		 158 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  40.68 
 
 		 142 aa  88.6  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  42.37 
 
 		 357 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  36.8 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  39.68 
 
 		 337 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  40.52 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  38.35 
 
 		 167 aa  88.2  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  35.2 
 
 		 148 aa  87.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  37.04 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  37.04 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  37.39 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  39.5 
 
 		 265 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  43.4 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  42.74 
 
 		 357 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  37.29 
 
 		 159 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  41.8 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  41.23 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  41.32 
 
 		 149 aa  84.7  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  35.82 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  40.98 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  38.69 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  38.52 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>