171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2585 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  54.3 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  53.38 
 
 		 265 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  55.48 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  51.57 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  51.57 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  44.9 
 
 		 307 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  47.06 
 
 		 327 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  42.11 
 
 		 320 aa  101  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  40.67 
 
 		 342 aa  97.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  43.7 
 
 		 338 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  45.13 
 
 		 337 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  37.59 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  42.95 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  94.4  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40.83 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  38.81 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  36.81 
 
 		 162 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  39.39 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  34.21 
 
 		 334 aa  92.8  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  34.21 
 
 		 351 aa  93.2  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  40.83 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  40.69 
 
 		 328 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  40.14 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  35.29 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  40.68 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  38.84 
 
 		 199 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  87.8  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  40.6 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  35.09 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  38.66 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  39.5 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  37.04 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  47.37 
 
 		 203 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  37.78 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  39.17 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  37.14 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  39.47 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  36.67 
 
 		 178 aa  84.3  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  41.96 
 
 		 195 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  38 
 
 		 227 aa  84.3  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  45.28 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  42.45 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  35.61 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  36.36 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  36.67 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  40.34 
 
 		 323 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  36.55 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  39.53 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  39.01 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  39.5 
 
 		 357 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  39.57 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  44.34 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  40.17 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  38.76 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  32.5 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  36.75 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  38.28 
 
 		 365 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  39.32 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.66 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  34.23 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  40.87 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  40.87 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  42.37 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  34.04 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  32.12 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  35.97 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  34.33 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  37.23 
 
 		 302 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  37.04 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  41.75 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  38.26 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.92 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  43.4 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  39.29 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  34.78 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  34.78 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  31.2 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  35.37 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  32.65 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  33.09 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  32.39 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  36.96 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  32.8 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  37.82 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  37.31 
 
 		 324 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35.21 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  33.09 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  39.71 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  35.8 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  36.96 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  34.75 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>