195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1379 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  342  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  97.96 
 
 		 174 aa  285  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  83.66 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  67.94 
 
 		 318 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  58.78 
 
 		 365 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  61.15 
 
 		 357 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  68.97 
 
 		 319 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  65.04 
 
 		 357 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  54.09 
 
 		 174 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  51.97 
 
 		 185 aa  157  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  51.63 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  46.47 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  48 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  59.38 
 
 		 324 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  56.92 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  50.68 
 
 		 172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  57.14 
 
 		 323 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  45.62 
 
 		 307 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  45.88 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  52.41 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  44.52 
 
 		 167 aa  131  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  35 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  48.57 
 
 		 321 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  49.3 
 
 		 328 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  39.88 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  46.67 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  46.04 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  42.07 
 
 		 320 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  42.14 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  43.65 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  40.79 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  43.07 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  40.28 
 
 		 342 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  42.07 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  41.18 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  43.07 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  36.91 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  38.93 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  41.01 
 
 		 338 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  36.42 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  40.83 
 
 		 351 aa  95.5  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  40.83 
 
 		 334 aa  95.5  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  37.86 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  42.98 
 
 		 153 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  42.98 
 
 		 153 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  41.27 
 
 		 337 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  44.92 
 
 		 327 aa  91.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  41.79 
 
 		 151 aa  91.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  40.77 
 
 		 168 aa  90.9  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  36.42 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  38.33 
 
 		 191 aa  87.8  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  35.76 
 
 		 161 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  45.19 
 
 		 203 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  35.76 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  44 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  39.75 
 
 		 161 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  37.59 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  38.28 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  37.91 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  37.91 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.29 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  38.53 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  40.5 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  36.42 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  35.65 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  37.19 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  32.67 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  34.34 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  35.92 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  39.2 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  34.12 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  40.91 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  35.92 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  37.01 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  30.18 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  28.4 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  38.74 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  35.51 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  35.82 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  35.82 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  30.61 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  41.58 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  37.07 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  34.81 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  34.97 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  36.69 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  34.44 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  31.9 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  29.84 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  34.27 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  30.17 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  37.14 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  32.41 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  34 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>