194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4422 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  90.58 
 
 		 153 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  66 
 
 		 159 aa  205  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  64.71 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  61.44 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  62.09 
 
 		 161 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  61.44 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  63.51 
 
 		 160 aa  186  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  51.13 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  50.38 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  46.05 
 
 		 184 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  46.27 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  44.22 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  41.55 
 
 		 179 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  40.82 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  39.57 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  39.73 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  41.79 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  40.43 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  41.91 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  41.04 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  42.52 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  39.35 
 
 		 185 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  39.69 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  38.71 
 
 		 191 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  38.06 
 
 		 178 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  38.64 
 
 		 181 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  34.19 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  41.32 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  38.03 
 
 		 176 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  36.3 
 
 		 307 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  41.53 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  37.16 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  38.02 
 
 		 199 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  40.68 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  39.32 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  40.68 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  40.68 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  34.31 
 
 		 320 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  36.88 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  38.52 
 
 		 357 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  31.94 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  38.05 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  40.37 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  37.7 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  41 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  37.29 
 
 		 338 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  37.29 
 
 		 337 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  37.7 
 
 		 365 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  32.54 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  32.06 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  34.88 
 
 		 318 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  35.4 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  30.14 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  33.79 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  33.79 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  31.85 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  31.01 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  32.76 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  31.34 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  37.61 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  32.59 
 
 		 323 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  37.93 
 
 		 357 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  36.27 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  34.06 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  34.75 
 
 		 319 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  35.66 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  36.61 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  33.08 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.82 
 
 		 334 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  33.94 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  32.85 
 
 		 342 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  27.21 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  36.89 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.82 
 
 		 351 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  30.47 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  27.14 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  34.13 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  29.08 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  33.9 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  34.69 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  28.86 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  33.62 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  40.4 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  37.5 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  33.06 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2016  hypothetical protein  34.23 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  32.28 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  35.29 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  34.01 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  34.45 
 
 		 327 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>