159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2016 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2016  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  29.5 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  33.56 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  34.74 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  32.23 
 
 		 169 aa  67  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  31.09 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  37.36 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  29.06 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  30.28 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  28.38 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  29.31 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  28.08 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  26.83 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  35.58 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  27.64 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  34.31 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  31.51 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  29.06 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  26.47 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  29.05 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  27.64 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  27.21 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  25.35 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  30.43 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  26.12 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  28.1 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  36.25 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  30.4 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  31.25 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  23.89 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  28.19 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  30.23 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  28.78 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  27.5 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  32.69 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  27.59 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  25.81 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  30.5 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  34.15 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  28.81 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  26.88 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  29.03 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  32.65 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  29.51 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  28.57 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  29.51 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  28.28 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  32.63 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  24.58 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  30.47 
 
 		 202 aa  53.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  35.51 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  27.4 
 
 		 338 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  30.51 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  25.96 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  29.75 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  28.24 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  29.66 
 
 		 320 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  30.77 
 
 		 334 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  27.14 
 
 		 318 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  27.52 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  28.93 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  29.36 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  25.62 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  25.62 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  28.12 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  30.77 
 
 		 351 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  27.73 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  27.05 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  27.78 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  30.83 
 
 		 232 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  23.64 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  28.93 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  27.08 
 
 		 337 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  30.47 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  27.56 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  31.82 
 
 		 327 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  26.09 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  27.12 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  31.09 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  24.03 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  27.83 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>