178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31000 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  46.04 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  50.35 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  47.93 
 
 		 160 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  47.93 
 
 		 160 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  47.34 
 
 		 160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  42.42 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  48.84 
 
 		 168 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  46.92 
 
 		 179 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  45.22 
 
 		 195 aa  124  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  43.59 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  44.97 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  42.61 
 
 		 195 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  43.2 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  40.96 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  38.51 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  39.25 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  40.52 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  38.32 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  44.96 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  38.46 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.61 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  43.4 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  40.2 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  41.18 
 
 		 171 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  37.4 
 
 		 155 aa  72  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  36.11 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  38.21 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  35.51 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  37.25 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  34.55 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  32.73 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  37.61 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  32.89 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  34.48 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  36.11 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  39 
 
 		 161 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  34.09 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  40.95 
 
 		 302 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  36.8 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  31.82 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  35.85 
 
 		 174 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  35.25 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  34.78 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  35.14 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  34.67 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  36.36 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  36.75 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.42 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  38.98 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.66 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  30.89 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  34.56 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  39.13 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  27.39 
 
 		 138 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  34.31 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  37.86 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  35.61 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  37.29 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  32.41 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  37.29 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  33.06 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  37.29 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  33.76 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  33.55 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  37.29 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  34.68 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  31.21 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  34.58 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  38.32 
 
 		 162 aa  62  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  30.41 
 
 		 170 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  34.91 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.17 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  37.17 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  29.51 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  33.96 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  36.79 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  34.62 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  37.74 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  39.62 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  32.64 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  33.94 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0174  hypothetical protein  36.19 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  34.4 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  34.43 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  31.08 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  40.71 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  35 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  33.6 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  32.77 
 
 		 334 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  35.71 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  42.05 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  33.6 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  32.77 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>