186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3578 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  45.15 
 
 		 227 aa  150  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  52.55 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  43.02 
 
 		 168 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  44.19 
 
 		 160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  44.19 
 
 		 160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  44.77 
 
 		 160 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  44.32 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  48.03 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  47.14 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  45.86 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  46.15 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  36.52 
 
 		 195 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  44.97 
 
 		 168 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  39.24 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  42.86 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  35.83 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  41.84 
 
 		 182 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  37.3 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  31.31 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.61 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.83 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  41.67 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  41.58 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  28.87 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  35.58 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  35.92 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  37.14 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  32.26 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  30.08 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  37.14 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  37.76 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  34.04 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  37.76 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.79 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  33.61 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  31.88 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  34.4 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  30.98 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  32.54 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  37.14 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  28.93 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  32.58 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  34.43 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  30.43 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  32.23 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  34.38 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  31.5 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  32.54 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  31.85 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  31.39 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  32.54 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  32.54 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  32.54 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  32.54 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  32.54 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  33.91 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  33.07 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  34.19 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  34.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  30.61 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  28.23 
 
 		 351 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  29.66 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  31.34 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  28.23 
 
 		 334 aa  61.6  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  28.88 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  35.92 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  30.39 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  34.19 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  34.19 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  27.84 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  32.28 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  31.09 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  30.19 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  27.78 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  25.6 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  38.83 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  30.58 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  32.28 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.82 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  30.63 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  35.64 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  35.87 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  28.99 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  30.4 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  33.58 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  29.29 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  27.91 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  28.1 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  29.86 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  30.34 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  34.62 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>