182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1170 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  42.2 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  41.98 
 
 		 232 aa  104  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  36.81 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  39.64 
 
 		 160 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  39.64 
 
 		 160 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  39.05 
 
 		 160 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  39.26 
 
 		 206 aa  94.4  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  39.85 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  35.71 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  36.84 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  41.79 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  35.71 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  35.03 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  33.56 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  36.89 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  36.89 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  38.71 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  36.72 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.07 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  34.43 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  36.07 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  38.6 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  42.98 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  37.14 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  39.47 
 
 		 323 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  39.05 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  35.83 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  34.06 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  36.07 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  36.84 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  37.29 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  35.83 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  41.24 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  34.75 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  34.96 
 
 		 318 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  37.17 
 
 		 321 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  36.22 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  37.17 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  31.82 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  34.4 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  34.33 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  31.36 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  31.06 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  36.28 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  29.03 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  31.72 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  29.27 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  35.96 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  34.65 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  34.43 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  36.29 
 
 		 357 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  34.68 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  30.89 
 
 		 147 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  38.54 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  32.61 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  30.37 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  30.43 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  35.77 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  30.65 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  38.78 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  30 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  29.06 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  30 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  30.16 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  32.67 
 
 		 145 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  26.11 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  33.87 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  25.14 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  28.46 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  33.63 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  32.28 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  28.49 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  33.63 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  32.8 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  33.06 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  33.06 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  32.46 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  31.5 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  28.68 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  31.67 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  34.92 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  30.53 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  30.53 
 
 		 334 aa  58.2  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  38.33 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  32.54 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.63 
 
 		 328 aa  57.8  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>