180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2787 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  82.56 
 
 		 195 aa  313  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  51.52 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  55.12 
 
 		 179 aa  134  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  43.41 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  44.38 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  49.62 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  47.83 
 
 		 232 aa  117  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  38.2 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  44.62 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  35.67 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  39.23 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  40.14 
 
 		 168 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  36.81 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  49.18 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  39.62 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  39.29 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  37.93 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  36.43 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  31.1 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  35.82 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  30.71 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  38.89 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  35.59 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  36.89 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  34.11 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  36.21 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  36.89 
 
 		 139 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  32.57 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  38.46 
 
 		 319 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  35.29 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  34.38 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  40.4 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  35.92 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  33.06 
 
 		 357 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  34 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  34.58 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  31.65 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  36.72 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  39.62 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  36.72 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  34.03 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  35.96 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  33.59 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  35.88 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  36.75 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  35.59 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  36 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  35.34 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  34.55 
 
 		 162 aa  62  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  37.27 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  33.96 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  32.41 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  37.5 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.24 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  33.62 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  36.45 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  37.27 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  36.61 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  34.55 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  35.58 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  33.04 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  32.17 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  30.22 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  30.17 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  34.48 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  37.14 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  39.53 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  32.48 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  35.85 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  31.71 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  38.2 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  35.83 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  32.32 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  28.69 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  38.2 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  38.05 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  38 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  37.93 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  35.85 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  31.73 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  33.04 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  32.76 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  35.85 
 
 		 351 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  31.58 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  31.03 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  26.03 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  37.36 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  31.85 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  34.58 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  36.05 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  33.64 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  32.54 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  32.48 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.93 
 
 		 265 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>