190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4927 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  97.3 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  87.16 
 
 		 148 aa  263  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  87.16 
 
 		 148 aa  263  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  87.16 
 
 		 148 aa  262  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  85.14 
 
 		 148 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  45.21 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  44.52 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  45.83 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  45.83 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  45.83 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  42.28 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  44.17 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  45 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  41.13 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  41.13 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  41.13 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  41.13 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  41.13 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  41.13 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  41.13 
 
 		 429 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  44.92 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  44.35 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  45.54 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  35.77 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.54 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  36.75 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  34.11 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  34.88 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  33.85 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  33.85 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  31.65 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  34.11 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  34.11 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  33.85 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  34.11 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  32.39 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  42.42 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  37.16 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  33.05 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  36.3 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  39.39 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  30.56 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  31.16 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  34.78 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  32.56 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  34.25 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  32.03 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  31.78 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  35.16 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  32.54 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  31.69 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  36.17 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  32.37 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  34.9 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  35.09 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  36.84 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  32.5 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  37.29 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  35.09 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  27.54 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  35.85 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  27.54 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  37.38 
 
 		 302 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  35.66 
 
 		 185 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  36.44 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  31.97 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  37.31 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  34.03 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  36.44 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  26.87 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  32.06 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  34.69 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  30.83 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  25.38 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  30.58 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  29.93 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  33.02 
 
 		 351 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  34.19 
 
 		 206 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  33.02 
 
 		 334 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  29.61 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  31.13 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  38.78 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  29.06 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  31.13 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  34.68 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  28.86 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  37.38 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  34.23 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  26.47 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  29.32 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  30.3 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  27.19 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  28.35 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  32.52 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>