124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3066 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3066  protein of unknown function DUF461  100 
 
 
155 aa  300  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000562803  hitchhiker  0.00471695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  40.35 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1778  protein of unknown function DUF461  36.36 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  37.72 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  35.83 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  38.6 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  35.96 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  37.04 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  37.17 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  37.17 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  37.17 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  36.75 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  31.69 
 
 
145 aa  60.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 
179 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  37.11 
 
 
187 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  35.85 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  36.28 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  35.85 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  35.85 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  35.85 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  35.85 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  35.85 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  31.58 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  35.71 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  33.04 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  34.17 
 
 
429 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  32.71 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  31.91 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  32.71 
 
 
148 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  32.17 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  32.17 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  33.59 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  35.14 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  33.59 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  36 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  31.71 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  29.75 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  35.48 
 
 
191 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.91 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  36.51 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.34 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  31.03 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  35.45 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  32.17 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  35.45 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  30.67 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  36.27 
 
 
162 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  38.26 
 
 
158 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  35.65 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  32.43 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  34.23 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  35.51 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  31.43 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  35.25 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  31.71 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  33.62 
 
 
227 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  33.87 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  37.62 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  33.64 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  32.03 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  30.51 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  30.25 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  31.78 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  32.12 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  27.97 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  31.58 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  26.36 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  30.33 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  29.51 
 
 
338 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  30.4 
 
 
163 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  31.25 
 
 
174 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  31.93 
 
 
161 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  26.09 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  32.56 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  30.89 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  37.62 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  31.07 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  34.23 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  29.79 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  32.63 
 
 
328 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  26.09 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  31.03 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  31.58 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  32.04 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  31.15 
 
 
320 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  28.21 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  29.91 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  29.91 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>