167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1778 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1778  protein of unknown function DUF461  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  41.62 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  34.97 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  34.51 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  30.66 
 
 		 324 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  36 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  33.86 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  30.15 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  36.13 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  36.13 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  30.15 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  34.29 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  30.15 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  30.37 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  32.28 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  31.69 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.82 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  62  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  35.05 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  31.13 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  27.22 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  33.82 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  29.17 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  33.64 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  30.37 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  29.58 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  36.46 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  36.46 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  36.46 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  34.15 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  25.66 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  31.97 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  33.94 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  36.16 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  30.33 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  29.13 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  29.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  31.86 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  30.97 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  30.43 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  37.11 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  34.02 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  31.03 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  27.4 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  29.71 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.75 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  30.5 
 
 		 365 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  28.79 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  34.69 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  33.63 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3066  protein of unknown function DUF461  36.36 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000562803  hitchhiker  0.00471695 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  28.15 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  32.29 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  31.34 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  29.2 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  27.54 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  33 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  35.05 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  29.24 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  32.61 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  28.02 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  32.04 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  30.66 
 
 		 320 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  27.19 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  31.53 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  31.48 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  31.11 
 
 		 323 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  32.67 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  30.91 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  30.43 
 
 		 166 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  30.51 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  31.3 
 
 		 357 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  29.1 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  27.5 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  29.58 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  34.02 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  35.9 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  27.1 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  31.68 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  34.02 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  29.1 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  27.1 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  32.41 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  33.64 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  34.41 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  29.03 
 
 		 357 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  28.44 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  28.44 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  29.27 
 
 		 307 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  29.67 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  25.29 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  30.43 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>