56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0133 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  100 
 
 		 175 aa  364  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  78.95 
 
 		 184 aa  277  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  46.29 
 
 		 196 aa  160  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  49.67 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  49.02 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  48.67 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  41.07 
 
 		 324 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  41.42 
 
 		 323 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  39.26 
 
 		 357 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  38.69 
 
 		 318 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  41.56 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  36.81 
 
 		 365 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  43.66 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  38.41 
 
 		 357 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  43.54 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  44.12 
 
 		 176 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  40.97 
 
 		 319 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  39.52 
 
 		 334 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  39.52 
 
 		 351 aa  123  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  38.64 
 
 		 327 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  36.42 
 
 		 328 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  37.43 
 
 		 337 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  41.78 
 
 		 320 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  37.65 
 
 		 342 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  39.19 
 
 		 321 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.25 
 
 		 338 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  39.46 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  33.54 
 
 		 264 aa  90.9  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  32.91 
 
 		 245 aa  87  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  30.36 
 
 		 302 aa  85.5  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  32.22 
 
 		 243 aa  84  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  31.37 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  35.29 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  30.72 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  30.46 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  30.22 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  31.17 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  34.18 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  27.03 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  28.95 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  26.62 
 
 		 247 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5009  nuclear export factor GLE1  28.38 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  27.46 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  27.59 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  27.59 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  27.59 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  26.03 
 
 		 253 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  27.59 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  28.28 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  26.9 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  27.59 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  27.59 
 
 		 206 aa  44.3  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  26.62 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  26.21 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  23.65 
 
 		 244 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  27.84 
 
 		 247 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>