58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1125 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  100 
 
 		 251 aa  491  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  62.81 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  51.76 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  44.49 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  43.53 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  46.29 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  39.79 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  40.98 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  40.11 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  40 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  37.99 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  41.07 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  43.92 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  36.59 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  36.69 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  35.95 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00610  hypothetical protein  35.24 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0768346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  35.24 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  36.48 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  37.25 
 
 		 176 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  32.93 
 
 		 176 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.02 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.02 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  30.49 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  29.27 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  30.72 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  31.88 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  32.69 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  29.27 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  29.27 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  29.27 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  28.05 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  28.66 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  28.31 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  28.66 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  28.31 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  30.38 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  29.31 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  29.27 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  27.44 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  30.46 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  31.33 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  27.81 
 
 		 365 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  29.63 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  28.38 
 
 		 357 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  30.19 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  30.43 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  28.4 
 
 		 321 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  30.25 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  28.79 
 
 		 327 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  28.09 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  27.72 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  28.1 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5009  nuclear export factor GLE1  29.05 
 
 		 146 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1131  nuclear export factor GLE1  32.79 
 
 		 149 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0525564  hitchhiker  0.00578677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  31.58 
 
 		 324 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  28.7 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0925  nuclear export factor GLE1  27.81 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.225489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>