51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1123 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  80.57 
 
 
240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  48.85 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  50.59 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  45.6 
 
 
250 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  41.63 
 
 
270 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  45.1 
 
 
237 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  43.04 
 
 
253 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  49.47 
 
 
249 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  40.67 
 
 
247 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  37.66 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  42.53 
 
 
244 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  44 
 
 
251 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  38.65 
 
 
277 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  36.49 
 
 
233 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00610  hypothetical protein  39.66 
 
 
230 aa  99.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0768346  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  41.03 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  32.65 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  34.19 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.66 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.47 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  34.38 
 
 
176 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  32.47 
 
 
176 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  35.06 
 
 
178 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  33.54 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  34.19 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  30.82 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  32.26 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  30.06 
 
 
320 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  29.51 
 
 
365 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  28.93 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  25.97 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  30.57 
 
 
357 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  28.95 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  24.12 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  25.54 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  32.12 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  24.12 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  26.22 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  30.39 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  25.61 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  26.22 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  28.83 
 
 
357 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  28.49 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  25.61 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  25.61 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  23.81 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  26.27 
 
 
327 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  28.74 
 
 
184 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  28.49 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  27.52 
 
 
338 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>