29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0925 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0925  nuclear export factor GLE1  100 
 
 
150 aa  303  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1131  nuclear export factor GLE1  57.81 
 
 
149 aa  153  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0525564  hitchhiker  0.00578677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  36.99 
 
 
206 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  37.32 
 
 
206 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  37.67 
 
 
206 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  37.67 
 
 
206 aa  93.6  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  37.67 
 
 
206 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  37.67 
 
 
206 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  37.67 
 
 
206 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  37.67 
 
 
206 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  36.62 
 
 
206 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  36.62 
 
 
206 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  39.83 
 
 
220 aa  80.1  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  32.58 
 
 
265 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  29.11 
 
 
250 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  29.1 
 
 
247 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  27.91 
 
 
327 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  29.94 
 
 
237 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  30.23 
 
 
302 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  27.81 
 
 
251 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  28.48 
 
 
270 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  26.89 
 
 
253 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  27.41 
 
 
277 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  27.33 
 
 
244 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  28.29 
 
 
337 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  27.18 
 
 
166 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  30 
 
 
338 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  29.6 
 
 
180 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  25.62 
 
 
176 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>