58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4175 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  100 
 
 
237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  63.16 
 
 
247 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  46.94 
 
 
253 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  44.08 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  43.6 
 
 
251 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  44.63 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  49.7 
 
 
247 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  44.63 
 
 
240 aa  154  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  45.25 
 
 
254 aa  148  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  40.91 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  43 
 
 
249 aa  134  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  42.14 
 
 
244 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  42.57 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  38.86 
 
 
277 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  42.18 
 
 
265 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  29.49 
 
 
206 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  36.06 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  30.8 
 
 
206 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  28.94 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  30.51 
 
 
206 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  29.06 
 
 
206 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  28.94 
 
 
206 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00610  hypothetical protein  33.95 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0768346  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  28.51 
 
 
206 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  28.51 
 
 
206 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  28.51 
 
 
206 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  29.24 
 
 
206 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  29.32 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  31.95 
 
 
196 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  31.06 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  36.36 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  36.94 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  33.48 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  31.65 
 
 
177 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  29.07 
 
 
334 aa  62  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  29.07 
 
 
351 aa  62  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  33.33 
 
 
176 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  32.04 
 
 
365 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  30.41 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  28.65 
 
 
184 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  27.68 
 
 
175 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  28.03 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  31.84 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  30.9 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  27.37 
 
 
328 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  31.17 
 
 
166 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  28.49 
 
 
337 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  30.95 
 
 
342 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  29.07 
 
 
320 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  32.02 
 
 
357 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  29.12 
 
 
327 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  35.29 
 
 
302 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  30.72 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  29.75 
 
 
338 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0925  nuclear export factor GLE1  29.94 
 
 
150 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1131  nuclear export factor GLE1  30.89 
 
 
149 aa  42.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0525564  hitchhiker  0.00578677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  27.85 
 
 
176 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  24.58 
 
 
323 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>